Les recherches du HSGO sur le Mali couvrent cinq domaines fondamentaux: le cadre juridique régissant la sécurité ; les principales régions et territoires affectés par l’insécurité ; les diverses communautés du Mali notamment les Arabes, Songhay, Touareg (Kel
Tamasheqs), Bambara, Malinké, Bobo, Khassonké, Soninké, Sénoufo, Minianka, Bozo, Peuls et Dogon; les acteurs non étatiques, les normes et les mécanismes qui façonnent la sécurité hybride; ainsi que les acteurs et institutions sécuritaires étatiques de l’État malien.